TRT kan de lichaamseigen spermaproductie beïnvloeden, omdat de hormoonhuishouding van buitenaf wordt gestuurd. Daarom wordt bij een bestaande of geplande kinderwens bijzonder zorgvuldig afgewogen of een TRT geschikt is.

De effecten kunnen per therapievorm verschillen: de orale bio-identieke testosterontherapie biedt een flexibele regelbaarheid en kan bij een kinderwens worden opgenomen in een individueel behandelplan, omdat deze de vruchtbaarheid doorgaans niet beïnvloedt. Gel en met name injecties hebben vanwege hun systemische depotwerking een sterke invloed op de hormonale as, waardoor rekening moet worden gehouden met een duidelijke afname van de spermaproductie.